Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRRTQ9BXP5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRRTQ9BXP5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms