Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SSBP3Q9BWW4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP3Q9BWW4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms