Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN3Q9BTN0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms