Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C2orf88Q9BSF0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms