Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC39A3Q9BRY0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC39A3Q9BRY0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms