Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEC22CQ9BRL7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms