Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms