Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF559Q9BR84 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF559Q9BR84 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms