Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF1Q9BQI6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLF1Q9BQI6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLF1Q9BQI6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms