Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITX2Q99697 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PITX2Q99697 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms