Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
MEIS3Q99687 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms