Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3CQ99613 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3CQ99613 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms