Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MMS19Q96T76 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMS19Q96T76 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMS19Q96T76 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms