Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBGCP5Q96RT8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBGCP5Q96RT8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBGCP5Q96RT8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms