Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNMA5Q96PV4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNMA5Q96PV4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms