Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms