Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms