Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms