Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGD4Q96M96 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms