Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00477Q96M19 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00477Q96M19 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms