Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALPK3Q96L96 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALPK3Q96L96 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALPK3Q96L96 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms