Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUSD3Q96L08 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUSD3Q96L08 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms