Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms