Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD1Q96GM5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD1Q96GM5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms