Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTUB1Q96FW1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUB1Q96FW1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms