Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM12Q96EX1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms