Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAF2Q96CS3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAF2Q96CS3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAF2Q96CS3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAF2Q96CS3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAF2Q96CS3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAF2Q96CS3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms