Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4CQ96CF2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4CQ96CF2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms