Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYTL4Q96C24 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYTL4Q96C24 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYTL4Q96C24 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms