Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPTQ96BT3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms