Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN23Q96B33 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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