Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EME1Q96AY2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EME1Q96AY2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms