Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNX21Q969T3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms