Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM63Q969Q1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms