Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-CQ95604 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-CQ95604 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms