Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFRSF25Q93038 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF25Q93038 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms