Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PRG4Q92954 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PRG4Q92954 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms