Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CELF1Q92879 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF1Q92879 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF1Q92879 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms