Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA4DQ92854 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA4DQ92854 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms