Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KIFAP3Q92845 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KIFAP3Q92845 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms