Protein–RNA interactions for Protein: Q92597

NDRG1, Protein NDRG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG1Q92597 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDRG1Q92597 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDRG1Q92597 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG1Q92597 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms