Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM3CQ92520 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM3CQ92520 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms