Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RHBDD1Q8TEB9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RHBDD1Q8TEB9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RHBDD1Q8TEB9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RHBDD1Q8TEB9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD1Q8TEB9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD1Q8TEB9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RHBDD1Q8TEB9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms