Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF3IP1Q8TDR0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms