Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MDM1Q8TC05 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms