Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NKX2-3Q8TAU0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX2-3Q8TAU0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms