Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HELBQ8NG08 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HELBQ8NG08 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms