Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC148Q8NFR7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms