Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCPH1Q8NEM0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCPH1Q8NEM0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms