Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC191Q8NCU4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC191Q8NCU4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms